El I.E.S. Doctor Marañón ofrece estudios para todos los niveles de la Educación Secundaria Obligatoria (ESO), de 1º a 4º, así como para los dos cursos de Bachillerato (1º y 2º) en la modalidad de Ciencias y Tecnología y en la modalidad de Humanidades y Ciencias Sociales.

Tanto la ESO como el Bachillerato puede cursarse en modalidad bilingüe en inglés.

Todos los estudios se desarrollan en el turno diurno, en horario de 8:15 a 15:05.