Todo Centro educativo debe tener una identidad propia, una forma de trabajar, un estilo personal, unas características que le hagan distinto a los otros. Para lograr este objetivo el IES Santamarca basa su Proyecto Educativo en los siguientes principios:
a) Educación integral de los alumnos en un ambiente de convivencia y detrabajo.
b) Proceso de enseñanza-aprendizaje desde la libertad, la justicia, la igualdad y la pluralidad.
c) Tolerancia, cooperación y solidaridad entre las personas potenciando el diálogo y el respeto de los derechos humanos.
d) Educación personalizada según el desarrollo psicoevolutivo de los alumnos.
e) Desarrollo de la autoestima, el espíritu crítico y la creatividad.
f) Formación desde la responsabilidad individual, el esfuerzo y la autoexigencia.
g) Implicación de los alumnos en las actividades académicas y culturales del Instituto
h) Participación en Proyectos y Programas educativos españoles e internacionales y aplicación de las TIC (Tecnologías de la Información y de la Comunicación) en el proceso formativo.